Una de les propietats del germinats és la predigestió de les proteïnes que els fa de més fàcil digestió. Fins i tot, alguns aliments , com els llegums, que poden presentar problemes de flatulències, són fàcilment assimilables quan han germinat (per això és tant important els remullat dels llegums per evitar les flatulències). Ajuden a reparar la flora intestinal. Els cereals que contenen gluten i es germinen, tampoc poden ser consumits pels celíacs.